Đã gần hai thập kỷ trôi qua kể từ ngày Antoinette Giry, người phụ trách Corps de Ballet của Nhà hát Opera Paris, cứu thoát một cậu bé với khuôn mặt bị biến dạng khủng khiếp từ một gánh xiếc và đưa về sống trong mê cung những tầng hầm bên dưới nhà hát. Đó chính là Erick, tức nhân vật Bóng ma. Về sau, tình yêu mãnh liệt nhưng không được đáp lại với cô ca sĩ xinh đẹp trong dàn đồng ca đã khởi đầu cho một loạt những sự kiện bi thảm, buộc Erick phải rời khỏi Paris, mãi mãi.

Khi đang trong giờ phút hấp hối, Madame Giry mới kể lại toàn bộ bí mật về Phantom, về chuyến đi tới New York, nơi cuối cùng Erick đã là ông chủ giàu có và đang xây Nhà hát Opera Manhattan chỉ để một lần nữa, được gặp người mình yêu. Nhưng chuyến đi của cô ca sĩ đến New York lại là khởi đầu cho một bi kịch mới, còn khủng khiếp hơn nhiều lần Paris…